納稅人取得高新資格后，應(yīng)當(dāng)在3年有效期內(nèi)，定期對知識產(chǎn)權(quán)的取得、研發(fā)項目的數(shù)量及質(zhì)量、高新收入占比、研發(fā)費用投入占比、科技人員占比等高企認(rèn)定指標(biāo)展開關(guān)聯(lián)的、持續(xù)的、全面的評估。本案中，涉案企業(yè)就自查發(fā)現(xiàn)的享受非應(yīng)享稅收優(yōu)惠予以申報補(bǔ)繳，阻斷了稅務(wù)違法責(zé)任追究。具體而言，高新技術(shù)企業(yè)開展自查應(yīng)關(guān)注以下要點：

（一）是否按照相關(guān)規(guī)定進(jìn)行企業(yè)更名、發(fā)生與認(rèn)定條件有關(guān)的重大變化是否及時向認(rèn)定機(jī)構(gòu)報告，是否及時填報年度發(fā)展情況報表

根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》第17條，高新技術(shù)企業(yè)發(fā)生更名或與認(rèn)定條件有關(guān)的重大變化（如分立、合并、重組以及經(jīng)營業(yè)務(wù)發(fā)生變化等）應(yīng)在三個月內(nèi)向認(rèn)定機(jī)構(gòu)報告。企業(yè)更名的，應(yīng)及時取得重新核發(fā)的認(rèn)定證書。并由專人負(fù)責(zé)高新技術(shù)企業(yè)資質(zhì)的維護(hù)工作，包括但不限于在高新認(rèn)定管理工作網(wǎng)填報年報、協(xié)調(diào)統(tǒng)計、稅局等部門有關(guān)高新信息的填寫審核，保證各部門報送數(shù)據(jù)除統(tǒng)計口徑差異外的一致性。

（二）知識產(chǎn)權(quán)申報數(shù)量、相關(guān)性、對產(chǎn)品的核心支持作用等是否符合認(rèn)定條件

企業(yè)應(yīng)就知識產(chǎn)權(quán)申報數(shù)量是否符合要求、知識產(chǎn)權(quán)是否與主營業(yè)務(wù)相關(guān)及其對產(chǎn)品的支持作用展開自查。為應(yīng)對地區(qū)對知識產(chǎn)權(quán)存在申報時間與取得時間限制等情形，企業(yè)應(yīng)摸索政策調(diào)整方向，并以此為依據(jù)在以后年度更加注重知識產(chǎn)權(quán)取得的連續(xù)性。

（三）從事研發(fā)和技術(shù)創(chuàng)新活動的科技人員占比是否符合比例要求

企業(yè)應(yīng)對照勞動合同、社保繳納、個稅申報明細(xì)等材料，排查研發(fā)人員真實性。研發(fā)人員真實性將直接影響相應(yīng)人員費用能否歸入研發(fā)費用，進(jìn)而影響研發(fā)費用占比，可能導(dǎo)致企業(yè)因占比低于認(rèn)定條件而被取消資格。

（四）各年度研發(fā)費用占同期銷售收入比例是否符合認(rèn)定條件

研發(fā)費用歸集既牽涉高新技術(shù)企業(yè)申請審查認(rèn)定通過與否，也將影響適用研發(fā)費用加計扣除稅收優(yōu)惠是否合規(guī)。為了能夠準(zhǔn)確核查企業(yè)各科目研發(fā)費用投入情況，企業(yè)應(yīng)按研發(fā)項目或科目歸集研發(fā)費用。具體而言：

1.通過比對工資表、個稅申報明細(xì)、勞動合同崗位信息，確認(rèn)其能否相互匹配印證，以工時為標(biāo)準(zhǔn)，對領(lǐng)導(dǎo)崗位和非全職研發(fā)人員工資做分配，確保研發(fā)人員真實性；

2.參考領(lǐng)料單等憑證確認(rèn)材料費應(yīng)歸屬于研發(fā)費用的真實性；

3.結(jié)合折舊明細(xì)表、固定資產(chǎn)發(fā)票，判斷設(shè)備是否用于研發(fā)，再進(jìn)一步考察研發(fā)活動是否與研發(fā)人員使用相匹配，確保折舊費用發(fā)生的真實性；

4.立足與企業(yè)合同關(guān)于設(shè)計項目規(guī)定的權(quán)利義務(wù)，企業(yè)應(yīng)綜合相關(guān)成果報告、測試記錄、勘察報告等反饋憑證，核查設(shè)計費用發(fā)生的真實性；

（五）高新收入的“高新”性及占比是否達(dá)標(biāo)

根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》的規(guī)定，高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%。企業(yè)可以就高新服務(wù)收入合同向技術(shù)市場予以備案，獲得第三方認(rèn)可；或就工程項目中用到的高新技術(shù)結(jié)合工程項目形成文字說明，以應(yīng)對高新檢查。